Lietuvoje hipoteka reglamentuojama LR Civilinio kodekso (Valstybės žinios, 2000, Nr. 74-2262), LR hipotekos įstatymo (Valstybės žinios, 1992, Nr. 31-951), LR Vyriausybės nutarimo „Dėl Lietuvos Respublikos hipotekos registro nuostatų patvirtinimo“ (Valstybės žinios, 2001, Nr. 90-3173) ir kt. nuostatomis.
Hipoteka - tai esamo ar būsimo skolinio įsipareigojimo įvykdymą apsaugantis turto įkeitimas, kai įkeisto turto savininkui paliekama nuosavybės teisė. Hipoteka neatima iš daikto savininko teisės valdyti, naudoti įkeistą daiktą bei juo disponuoti. Jei suėjus nustatytam terminui skola hipotekos kreditoriui negrąžinama, jis turi teisę reikalauti, kad įkeistas turtas būtų parduodamas iš varžytinių ir iš gautų pinigų atlyginta jam priklausanti suma. Hipoteka, neįregistruota hipotekos registre, negalioja.
Vadovaujančioji hipotekos registro tvarkymo įstaiga yra Teisingumo ministerija. Hipotekos registro tvarkymo įstaigos yra: vietinių hipotekos registrų - apylinkės teismų hipotekos skyriai ir Centrinė hipotekos įstaiga.
Asmuo, norėdamas įregistruoti hipoteką, turi kreiptis į VĮ „Registrų centras“ dėl nuosavybę patvirtinančio dokumento išdavimo. Šį dokumentą, o taip pat kitus reikalingus dokumentus pateikia notarui (juridinio asmens pateikia registracijos dokumentus ir banko pažymą apie finansinius duomenis). Notaras paruošia ir patvirtina hipotekos sutartį (hipotekos lakštą).
Gavęs notaro parengtus ir patvirtintus dokumentus, apmokėjęs raštinės rinkliavą už hipotekos registravimą (fizinis asmuo - 50 litų, juridinis asmuo - 100 litų), asmuo kreipiasi į nekilnojamojo turto buvimo vietos hipotekos skyrių. Hipotekos skyrius, gavęs reikiamus dokumentus, juos užregistruoja, atlieka formalų lakšto patikrinimą (ar lakštas patvirtintas notaro, ar visi lakšto laukai yra užpildyti ar pridėti visi reikalingi dokumentai) bei duomenis įrašo į hipotekos registrą ir ne vėliau kaip per 24 valandas perduoda centriniam hipotekos registrui. Hipoteka įsigalioja nuo jos įregistravimo centriniame hipotekos registre momento.
Ne vėliau kaip per 3 darbo dienas įregistruotas hipotekos lakštas kartu su pridėtais dokumentais ir pažymėjimu apie hipotekos įregistravimą išsiunčiami hipotekos kreditoriui.